不同的電極材料有著不同的特點：
鈦鍍鉑電極：耐腐蝕性相當好，可以在非常苛刻的條件下使用，但鉑的價格昂貴，資源較少，限製著其在國內的推廣。
鈦塗釕電極：是在鈦基體上塗敷釕(Ru)、銥(Ir)、鈦(Ti)的化合物，經高溫處理後形成其混合氧化物;由於釕(Ru)、銥(Ir)、鈦(Ti)的離子半徑非常接近，點陣結構和空間群屬於同一類型，因此在熱處理的共氧化中能形成 RuO2-IrO2-TiO2 的固溶體，具有優越的耐腐蝕性能，很適合作為電極材料。
石墨電極：石墨電極很容易被腐蝕，其原因主要有化學腐蝕和機械磨損;石墨作為陽極時，由於陽極氧化，石墨被氧化為 CO2 或 CO，使其晶體結構被破壞而損壞;在電滲析裝置中石墨電極損耗主要由於機械作用而造成的，高流速的極水對石墨有很強的衝刷作用，另一方面電極反應所產生的氣體對石墨有衝擊作用，加上電化學腐蝕，往往造成石墨顆粒剝落汙染水質甚至堵塞極水通道;隨著鈦塗釕電極的出現，石墨電極已逐漸被淘汰。
不鏽鋼電極：一般說來，不鏽鋼隻用作為陰極而不能作為陽極使用，否則因為天然水中多含有氯離子，會導緻不鏽鋼的陽極溶解生成二價的鐵、鎳和鉻離子。
正確選擇電極的材料對於延長電極的使用壽命、降低系統投資和運行費用具有重要的意義，對於不同水質可選用不同材料的電極：
1.以氯化物為主要成分的天然水，可優先選用鈦塗釕電極。
2.以硫酸鹽為主要成分的天然水，可優先選用鉛板、不鏽鋼、鈦塗釕電極。
3.以重碳酸鈣為主要成分的天然水，可優先選用不鏽鋼、鈦塗釕電極。
4.混合離子的天然水，可優先選用鈦塗釕、石墨以及鈦塗鉑電極。
淡水室、濃水室、極水室是如何區分的？
一張陽膜、一張隔板、一張陰膜組成一個膜對，陽膜、陰膜中間構成水室，在電場作用下，水室中的離子產生定向移動，當水室中離子經過牽引和膜的選擇透過性而離開該水室時，該水室稱為淡水室;相反，離子經過牽引和膜的選擇透過性而進入該水室時，該水室成為濃水室;陽膜、陰膜或隔板與電極之間產生的水室成為極水室。